MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 6849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008340	ACA	2	6	1379165	1379170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_008340	A	7	7	1379174	1379180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008340	ACG	2	6	1379201	1379206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_008340	AGG	2	6	1379247	1379252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_008340	GGTG	2	8	1380719	1380726	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008340	G	6	6	1380726	1380731	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008340	CCT	2	6	1381215	1381220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_008340	CCG	3	9	1381228	1381236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_008340	GCCA	2	8	1381255	1381262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_008340	CTT	2	6	1381267	1381272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_008340	GCG	2	6	1381358	1381363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_008340	GGC	2	6	1381385	1381390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_008340	GCC	2	6	1381439	1381444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_008340	CGG	2	6	1381463	1381468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_008340	GTC	2	6	1382216	1382221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_008340	GTG	2	6	1382306	1382311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008340	GGGCC	2	10	1382453	1382462	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3018	NC_008340	GGA	2	6	1382486	1382491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008340	ACCC	2	8	1383876	1383883	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3020	NC_008340	GGT	2	6	1383928	1383933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008340	GCT	2	6	1383961	1383966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_008340	CCG	2	6	1388233	1388238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_008340	GGAGGG	2	12	1388274	1388285	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008340	GTC	2	6	1391029	1391034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_008340	A	8	8	1391565	1391572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008340	CGG	2	6	1391631	1391636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_008340	ATGA	2	8	1392974	1392981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008340	TTG	2	6	1393681	1393686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_008340	GCC	2	6	1393689	1393694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_008340	GGT	2	6	1393695	1393700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008340	TTCA	2	8	1393756	1393763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_008340	GTCC	2	8	1393835	1393842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_008340	GTC	2	6	1394577	1394582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_008340	GCG	2	6	1394605	1394610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_008340	CCGGC	2	10	1397797	1397806	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3036	NC_008340	TCG	2	6	1398646	1398651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_008340	CGC	2	6	1398682	1398687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_008340	CCTG	2	8	1400780	1400787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_008340	CGGC	2	8	1404827	1404834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_008340	G	6	6	1407884	1407889	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_008340	GAC	2	6	1408970	1408975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_008340	CGC	2	6	1414475	1414480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_008340	TCC	2	6	1415750	1415755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_008340	GTGCC	2	10	1415783	1415792	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3045	NC_008340	GCC	2	6	1415809	1415814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_008340	C	6	6	1415813	1415818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3047	NC_008340	GGC	2	6	1415884	1415889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_008340	GCCG	2	8	1415915	1415922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_008340	CAAT	2	8	1415923	1415930	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_008340	ATA	2	6	1418252	1418257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008340	C	6	6	1418258	1418263	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3052	NC_008340	GGC	2	6	1422086	1422091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_008340	CGC	2	6	1422099	1422104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_008340	CGC	2	6	1422129	1422134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_008340	T	6	6	1422172	1422177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008340	GGT	2	6	1422308	1422313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_008340	GGT	2	6	1422319	1422324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008340	ACA	2	6	1422356	1422361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_008340	CCG	2	6	1422816	1422821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_008340	CGGG	2	8	1422858	1422865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3061	NC_008340	CGCT	2	8	1422887	1422894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_008340	AGG	2	6	1422910	1422915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_008340	GGC	2	6	1427763	1427768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_008340	GC	4	8	1427770	1427777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_008340	GCC	2	6	1427779	1427784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_008340	TCC	2	6	1428576	1428581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_008340	GTA	2	6	1428607	1428612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_008340	TGT	2	6	1428632	1428637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008340	CGG	2	6	1429198	1429203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_008340	CGG	2	6	1431495	1431500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_008340	AAG	2	6	1431517	1431522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008340	GCCG	2	8	1431556	1431563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_008340	CGC	2	6	1433027	1433032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_008340	GCG	2	6	1433035	1433040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_008340	GGC	2	6	1433744	1433749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_008340	CCAT	2	8	1434881	1434888	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_008340	CCG	2	6	1435955	1435960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_008340	GGGC	2	8	1435961	1435968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_008340	GCG	2	6	1435988	1435993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_008340	GCC	2	6	1435997	1436002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_008340	CGC	2	6	1436008	1436013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_008340	C	6	6	1439967	1439972	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3083	NC_008340	GTA	2	6	1444977	1444982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008340	GCC	2	6	1445730	1445735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_008340	CGG	2	6	1445739	1445744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_008340	TGC	2	6	1445745	1445750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_008340	TGGG	2	8	1449978	1449985	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_008340	CGCC	2	8	1449997	1450004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3089	NC_008340	GGCGG	2	10	1450005	1450014	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3090	NC_008340	GCGG	2	8	1450042	1450049	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3091	NC_008340	GTC	2	6	1450066	1450071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_008340	CGG	2	6	1450090	1450095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_008340	ATG	2	6	1450949	1450954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008340	GCCCG	2	10	1451006	1451015	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3095	NC_008340	CCG	2	6	1451029	1451034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_008340	CGA	2	6	1451943	1451948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_008340	GGC	2	6	1451983	1451988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_008340	GGCC	2	8	1452351	1452358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_008340	CAG	2	6	1452386	1452391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_008340	CG	3	6	1452408	1452413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_008340	G	6	6	1452413	1452418	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_008340	CCA	2	6	1452445	1452450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_008340	GTG	2	6	1452455	1452460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008340	GCCC	2	8	1452464	1452471	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3105	NC_008340	CA	3	6	1452497	1452502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_008340	CGG	2	6	1452959	1452964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_008340	CG	3	6	1452967	1452972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_008340	GCCG	2	8	1455811	1455818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_008340	GGC	2	6	1455833	1455838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_008340	GC	3	6	1455837	1455842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_008340	T	7	7	1455855	1455861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_008340	AGG	2	6	1455865	1455870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_008340	GCG	2	6	1457801	1457806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_008340	CGCC	2	8	1457816	1457823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3115	NC_008340	TGT	2	6	1459790	1459795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_008340	GAT	2	6	1459810	1459815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_008340	ACC	2	6	1459901	1459906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_008340	ACCA	2	8	1459923	1459930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_008340	A	6	6	1459943	1459948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008340	ACG	2	6	1459953	1459958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_008340	GTCCG	2	10	1460636	1460645	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3122	NC_008340	GCG	3	9	1460656	1460664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_008340	GTCC	2	8	1460665	1460672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_008340	G	6	6	1460712	1460717	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_008340	GTG	2	6	1461137	1461142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_008340	CGG	2	6	1461145	1461150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_008340	GGCC	2	8	1461158	1461165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_008340	C	6	6	1461164	1461169	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3129	NC_008340	AC	3	6	1461187	1461192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_008340	G	6	6	1464154	1464159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_008340	AAG	2	6	1466757	1466762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_008340	T	6	6	1466768	1466773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_008340	TGAC	2	8	1466797	1466804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3134	NC_008340	CATAAG	2	12	1466820	1466831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3135	NC_008340	ATTC	2	8	1466841	1466848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3136	NC_008340	GGC	2	6	1469006	1469011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3260	NC_008340	TCCT	2	8	1527647	1527654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3261	NC_008340	CAC	2	6	1527685	1527690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3262	NC_008340	CCT	2	6	1532152	1532157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3391	NC_008340	GTTT	2	8	1617297	1617304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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